"Ninjas ... los ninja eran ... despiadados semidioses, quienes gobernaron Japón con su karate en la tranquila edad ninja. Pero, "algunos" realizaron una forma prohibida de hara-kiri para almacenar sus almas en el templo de Kinkaku, esperando por una futura resurrección. Su historia se perdió, y la verdad tras la leyenda fue olvidada hace mucho tiempo.
Ahora, en el futuro en el que la globalización tecnológica y las redes sociales son las nuevas deidades de la sociedad, de repente, las almas de los ninjas siniestros han resucitado desatándose en las oscuras sombras de Neo-Saitama. Fujikido Kenji, es un hombre normal cuya esposa e hijo fueron asesinados en una guerra ninja por territorio, al enfrentarse a su propia muerte, Fujikido es poseído por una misteriosa alma ninja. Fujikido engaña a la muerte convirtiéndose en "Ninja slayer" un guerrero destinado a acabar con todos los ninjas malvados, mientras persigue su venganza personal".